تؤدي جرثومة المعدة إلى الإصابة ببعض الأمراض ومنها التهاب المعدة، وقرحة المعدة، وعسر الهضم، وبعض المشاكل في الجهاز الهضمي، وانسداد الأمعاء، أو ثقب المعدة، والارتداد المريئي، وزيادة احتمالية الإصابة بسرطان المريء، العد الوردي أو مرض الوردية، وهو مرض جلدي يصيب الوجه بالإحمرار .