تحدث الإصابة بالنزلات المعوية نتيجة عدوى فيروسية أو بكتيرية في الأمعاء عند تناول الطفل لطعام أو شراب ملوث، أو استخدام أدوات شخص مصاب بالمرض، أو لمس الطفل لأدوات ملوثة ثم وضع يده في فمه.
وتنتشر الإصابة بالنزلات المعوية بصفة خاصة في المدارس ودور الحضانة نتيجة لاختلاط الأطفال.